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Souche du coronavirus en Angleterre: fermer les frontières ne suffira pas à préserver la France

Souche du coronavirus en Angleterre: fermer les frontières ne suffira pas à préserver la France



SCIENCE – Et s’il était déjà trop tard? Le Royaume-Uni s’est reconfiné suite à l’annonce de l’émergence d’une nouvelle souche du coronavirus en Angleterre, possiblement plus contagieuse. Dans la foulée, de nombreux pays ont fermé préventivement leur frontière avec le pays, dont la France.Même si l’on ne sait pas si les multiples mutations de “VUI-202012/01” augmentent réellement la transmission, on peut se dire que mieux vaut prévenir que guérir. Pour autant, il est “tout à fait possible que le virus circule en France”, a précisé ce lundi 21 décembre Olivier Véran.Il y a effectivement plusieurs raisons de le craindre, mais cela ne veut pas dire que l’arrêt des liaisons avec le Royaume-Uni est totalement inutile. Par contre, il est nécessaire de ne pas s’arrêter là.Effet d’optiqueLa lignée provenant d’Angleterre a en effet déjà été séquencée une fois au moins en Australie et plusieurs fois au Danemark. Un cas a également été détecté en Italie et en Belgique.Mais notre vision est ici très, très partielle. Pour suivre à la trace les variants génétiques du coronavirus, il est nécessaire de séquencer le génome du Sars-Cov2. Dans un monde idéal, chaque test PCR positif serait analysé. C’est loin d’être le cas. Ce qui veut donc dire que la souche VUI-202012/01 est peut-être présente dans de nombreux pays, dont la France.Surtout que le Royaume-Uni est le pays qui fait le plus de séquençage de génome du virus au monde, de très, très loin. 38% de la totalité des séquences proviennent d’outre-Manche, ce graphique le montre bien. “Les Anglais ont séquencé plus de 120.000 génomes, en France on en a 2500”, précise Samuel Alizon, directeur de Recherche au CNRS, spécialiste de la modélisation des maladies infectieusesDe plus, cela prend du temps de séquencer un génome, il y a donc un délai entre ce que l’on voit et l’évolution en temps réel de l’épidémie de coronavirus.Et même si la souche provenant d’Angleterre ne circule pas encore en France, il n’est pas dit que le verrouillage des frontières empêche une importation. Comme le rappelle l’épidémiologiste Adam Kucharski sur Twitter, lors de la première vague de Covid-19, de nombreux pays européens ont stoppé les flux avec l’Asie. Mais l’analyse a posteriori des génomes du Sars-Cov 2 a montré que le virus est arrivé au Royaume-Uni via des pays européens, notamment l’Italie et l’Espagne… et ce avant que les premiers cas ne soient répertoriés dans ces pays.As countries introduce bilateral travel bans to tackle new variant, worth reflecting on this plot of early introductions – focus on incoming infections from East Asia didn’t stop indirect routes or arrivals from undetected outbreaks elsewhere (more: https://t.co/K6VFDx92PS) pic.twitter.com/sOUcXyHvpm— Adam Kucharski (@AdamJKucharski) December 20, 2020Cela ne veut pour autant pas dire que fermer les frontières est une mauvaise idée, rappelle sur Twitter Emma Hodcroft, chercheuse à l’université de Bâle, spécialiste de la génétique des virus: “Il est plus simple [d’empêcher la nouvelle souche de se répandre] avec 10 personnes plutôt qu’avec 1000”. Mais cela ne peut pas suffire.Mesures additionnelles Elle encourage ainsi les pays à améliorer leur dépistage, en particulier dans les régions où il y a d’importants flux en provenance de l’Angleterre. Voire de mettre en place une quarantaine ou un test obligatoire pour les personnes en provenance d’une zone à risque. La chercheuse recommande également de réaliser plus de séquençages du coronavirus afin de mieux cerner les nouveaux variants.C’est également ce que préconise le Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC) dans une note sur la nouvelle souche, publiée le 20 décembre. L’agence européenne recommande notamment aux autorités de santé d’identifier les personnes ayant été en contact avec des cas positifs liés à la nouvelle souche ou ayant voyagé dans une zone affectée et de leur offrir un dépistage, un isolement ainsi qu’un suivi des contacts. L’ECDC estime également que les mesures actuelles doivent être renforcées et que le séquençage des génomes doit être amélioré.Un dernier point, évoqué par ces deux sources, pourrait se révéler très utile: un test PCR bien particulier pourrait permettre d’y voir clair beaucoup plus rapidement. En effet, Science magazineprécise que l’un des tests PCR utilisés au Royaume-Uni, TaqPath, permettrait de repérer indirectement et sans séquençage les personnes porteuses de la nouvelle souche. C’est grâce à cela que le gouvernement britannique a pu affirmer que le variant était présent chez 26% des Londoniens positifs mi-novembre alors qu’il représenterait aujourd’hui 60% des cas.Mais François Balloux, directeur de l’UCL Genetics Institute,rappelle sur Twitter que les choses ne sont pas si simples. La mutation rendue visible via ce test PCR “est également présente dans d’autres lignées du virus”, notamment une autre courante au Royaume-Uni. L’ECDC, de son côté, demande aux laboratoires de santé publique “d’évaluer les implications” à ce sujet, tout en rappelant également que cette mutation décelable grâce à ce test PCR n’est pas spécifique à cette souche et “qu’une confirmation par séquençage est recommandée”.A voir également sur Le HuffPost: La nouvelle souche du covid-19 ne devrait pas “changer l’efficacité du vaccin”LIRE AUSSI :
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Source link : https://www.huffingtonpost.fr/entry/pour-empecher-la-souche-anglaise-de-simposer-en-france-fermer-les-frontieres-ne-suffira-pas_fr_5fe0a1bbc5b6e5158fa8e62d

Author : Grégory Rozières

Publish date : 2020-12-21 17:12:50

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Tags : Huffington Post

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